呼吸功能检查室由肺功能检查室和气管镜检查室组成。现有主任医师2人，主管技师1人，主管护师一人，硕士研究生一人，住院医师一人。负责全院电子支气管镜和肺功能检查，拥有最先进的OLPAS和PENTEX电子支气管镜及配套的清洁洗涤消毒设备；德国产大型12导联心肺运动仪，体描箱多功能肺功能仪，可开展通气功能、肺容积测定、小气道功能检测、气道阻力测定、弥散功能测定、残气功能测定、呼吸肌力测定、气体分布测定、高通气试验及气道反应性测定等检查。
    呼吸功能检查室年检测患者达万余人次，是全疆和西北五省乃至全国之最。目前所开展的业务及严格的质量控制和完善的肺功能检查报告流程处于全疆本专业领先水平。
    近年来在省级以上刊物发表专业论文10余篇，连续三年在中华医学会呼吸年会论文交流获优秀论文奖。
    肺功能检查主要用于明确呼吸功能障碍的类型、严重程度，推断呼吸系统疾病的性质，协助和论证临床的诊断。另外，肺功能检查在观察病情变化、反映治疗方法的疗效、评价手术和麻醉的耐受能力、预测疾病的转归、鉴定劳动能力、研究环境污染与卫生保健等方面均有重要的价值。常用的临床指针有：1、慢性阻塞性肺疾病；2、支气管哮喘；3、间质性肺疾病；4、咳嗽的病因分析；5、呼吸困难的病因分析；6、手术耐受能力的分析；7、肺功能损害的性质的严重程度评价；8、药物或疗效的效果评价等。