自治区人民医院儿科始建于1951年；1986年成立了新疆维吾尔自治区儿科研究所（内设：病毒室、血液室、免疫室）；1996年成立新生儿科；1999年成立了儿科教研室。经过几代人的努力和55年的持续发展，目前已成为集临床、保健、教学、科研为一体的综合科室，是三级甲等医院的重点科室。拥有一批资深专家和中青年技术骨干。为了促进学科发展更好地服务于新疆各族儿童。2005年9月成立了自治区人民医院附属儿科医院，包括：儿内一、儿内二、儿传、新生儿科、儿童急救中心、小儿外科、儿保、门诊、急诊、儿科研究所。
    儿内科：儿内科拥有主任医师6名，副主任医师10名，主治医师8名，医师5名，其中硕士1名。主管护理师2名，护理师12名，护士10名。
    儿科门诊：设有专家门诊，癫痫，血液，心脏，内分泌，矮小及儿童少年心理行为等专病门诊。全年每天24小时开诊(夜间设有急诊及留观室)，周六，周日及节假日都安排资深的医师出专家门诊。门诊静脉留观室除给各年龄组患儿进行静脉输液治疗外，还开展肌肉注射、皮内注射、鼻注药物及保留灌肠。近年来为方便喘息性肺炎、喘息性支气管炎及哮喘等患儿在门诊治疗，留观室开展了雾化吸入治疗。由于我院医护人员技术全面，医疗护理水平高，服务热情周到深受各族患儿和家长的信赖。儿科门诊人数和静脉留观的人数逐年增加。我们也非常珍惜患儿和家长对我们的信任，将开展更多的新业务，为患儿提供更全面更优质的服务，提供更优美更舒适的就诊环境。
    儿内科病房设106张床位，分儿内一科和儿内二科病区。
    儿内一病区：（位于新急救综合病房楼7层）主治肾脏、血液，呼吸等系统疾病。接收来自乌鲁木齐及全疆各地的疑难 危重病例：
    1、肾脏专业，治疗各种不明原因的血尿、蛋白尿、泌尿系感染、肾炎、IgA肾病、Alport综合征、薄基膜病等；在难治性肾病的诊治方面更有独到之处，吸引全疆各地乃至周边国家的患儿前来诊治。对继发性肾小球疾病如紫癜性肾炎、狼疮性肾炎、乙型肝炎抗原相关性肾炎等治疗积累了丰富的经验。率先在新疆开展了小儿经皮肾活检技术，自2000年以来应用先进的仪器设备已经成功地为200余例难治性肾小球疾病患儿经皮肾活检，明确了病理类型，提高了诊治水平。对于急慢性肾功能衰竭的诊治达到了领先水平。
    2、血液专业：已形成了有丰富临床经验的老、中、青各级医疗梯队。设有专门的小儿血液实验室。近年采用无痛小儿骨穿方法，极大地减轻了患儿的痛苦。对小儿长期发热，肝脾肿大，贫血，出血性等疑难疾病的诊治已居全疆领先地位，尤其对小儿白血病等恶性肿瘤的诊断治疗达国内先进水平。使小儿白血病不再成为不治之症。
    3、呼吸专业：治疗呼吸系统各种疑难杂症的救治如重症肺炎、慢性咳嗽、反复呼吸道感染、哮喘及先天性支气管、肺发育不全等。
    我科在上述各系统疾病的诊治方面在疆内处于领先地位，有的专业达国内先进水平。
    儿内二科（位于新急救综合病房楼8层）：主治神经、心血管、风湿免疫及儿科重症监护病房。
    1、小儿神经专业经几十年学科建设,拥有正规培训的高、中,、初级各层次专业人员；利用先进的大型仪器,如：1.5T核磁共振, 64排螺旋CT,视频脑电图,动态脑电图,肌电诱发电位,肌电图，PET—CT(派特)以及生化、免疫、病毒学,药物血浓度监测等项目开展小儿神经系统各类疾病的诊断治疗.如中枢神经系统感染,癫痫及持续状态,小儿脑性瘫痪,周围神经病,肌肉系统疾病,精神运动发育迟滞及神经遗传代谢病等。尤其是在小儿脑性瘫痪及癫痫的治疗独具特色,吸引了大批疆内乃至国外患者前来就医。在小儿脑瘫及癫痫诊治方面达到疆内领先水平,并与国内外保持同步。
    2、心血管专业：心血管疾病方面利用我院设备先进技术力量雄厚的优势，可以进行超声心动图、动态心电图、心向量、彩超等检查，明确各种心肌疾患如病毒性心肌炎、心肌病、心内膜弹力纤维增生症等诊断并提供有效的治疗。对各种原因引起的难治性心力衰竭、心律紊乱的诊治也有深入的研究。对先天性心脏病能明确诊断并给予治疗指导。
    3、风湿免疫系统疾病包括：系统性红斑狼疮、皮肌炎、混合结缔组织病、川崎病、风湿热、类风湿性关节炎及其他特发性关节炎等，我科都积累了成功救治的经验。还开展了原发性和继发性免疫缺陷病的诊治工作。
    4、内分泌系统疾病经多年学科建设,积累了丰富的临床经验,治疗各种原因导致的矮小症,性早熟,甲状腺功能减低,糖尿病,尿崩症等.
    儿童急救中心的儿科重症监护病房（位于新急救综合病房楼8层）：新疆自治区人民医院儿科急救中心是自治区境内唯一一家省级儿童急救中心，急救中心的前身是自治区人民医院儿科抢救室，具有50余年的悠久历史，在自治区儿科危重症抢救领域具有较高的学术地位，丰富的急救经验，较好的声誉。儿科急救中心于2006年建立，现设重症监护病床8 张，中心配有先进的多参数床旁监护仪、美国进口的PB840呼吸机、德国进口斯蒂芬CPAP无创呼吸机及斯蒂芬妮呼吸机。输液泵及床旁血浆置换机、血液透析机，床旁X-线摄片机，及中心供氧、中心负压装置等，依托丰富的临床经验及三级甲等医院临床检验科室雄厚的设备、技术资源优势，使我院儿科急救中心综合实力在疆内出类拔萃，较好的保证了急危重患儿的抢救及治疗。
    通过几代人的努力，儿科急救中心已拥有一支老中青结合的急救专业医疗、护理团队，并有各专业组资深专家组成的危重症抢救小组，多年来致力于各种危重症病人的抢救与治疗，成功救治各级地、州、县、市转诊来的重症肺炎，呼吸衰竭，哮喘持续状态，中毒性细菌性痢疾，心源性休克，急慢性肾功衰竭，急性肝衰竭，癫痫持续状态，病毒性脑炎，化脓性脑膜脑炎，结脑晚期，糖尿病酮症酸中毒，各种中毒，急性脊髓炎及多脏器功能衰竭的患儿。应用呼吸机治疗小儿呼吸衰竭居疆内先进水平，对感染性休克、多脏器功能衰竭，结脑晚期，急性肝衰竭等治疗具国内先进水平，明显降低了患儿的病死率。采用床旁血液虑过治疗肾功能衰竭伴急性肺水肿，多脏器功能衰竭，重症神经根炎，抢救成功率较高，大大缩短了疗程，治疗效果达国内先进水平。
    儿科教研室：成立于1999年。承担新疆医科大学和石河子医科大学的本科和专科的教学及临床实习工作，培养了大批医学工作者。共举办为期一年的儿科进修医师学习班23期，为基层培养了大批的儿科专业人才，其中很多人成为当地儿科的骨干。多次举办《儿科新进展学习班》和主办《新疆儿科学术交流会》，为促进新疆儿科事业的发展做出了巨大的贡献。
    我科还结合临床积极开展科研工作。“血浆纤维结合蛋白实验方法的建立和临床研究”获自治区卫生厅科技进步二等奖；“小儿肾小球疾病的研究和诊断治疗” 获自治区科技厅科技进步三等奖；主编儿科专业书籍《儿科医师继续教育必读》及《小儿急救手册》两部，深受儿科医师的欢迎和好评。
    我科严格遵循“仁爱、诚信、博学、严谨”的院训，实行人性化服务。奉行“一切以病人为中心”的服务理念。以高尚的医德,精湛的技术,合理的价格为全疆各族儿童的身心健康勤奋工作。